Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ckap5A2AGT5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ckap5A2AGT5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms