Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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