Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hdac5Q9Z2V6 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac5Q9Z2V6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms