Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Crlf3Q9Z2L7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Crlf3Q9Z2L7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Crlf3Q9Z2L7 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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