Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ilf3Q9Z1X4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms