Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnk1eQ9JMK2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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