Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Rabgef1Q9JM13 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rabgef1Q9JM13 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rabgef1Q9JM13 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rabgef1Q9JM13 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rabgef1Q9JM13 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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