Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Hmgn5Q9JL35 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn5Q9JL35 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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