Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C1ql3Q9ESN4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms