Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hmgn3Q9DCB1 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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