Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Med27Q9DB40 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms