Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TrmuQ9DAT5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TrmuQ9DAT5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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