Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tvp23bQ9D8T4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms