Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Derl3Q9D8K3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Derl3Q9D8K3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms