Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Nop56Q9D6Z1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nop56Q9D6Z1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nop56Q9D6Z1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nop56Q9D6Z1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Nop56Q9D6Z1 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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