Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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