Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PmpcbQ9CXT8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms