Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrc17Q9CXD9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms