Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms