Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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