Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nek8Q91ZR4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nek8Q91ZR4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms