Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccdc115Q8VE99 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccdc115Q8VE99 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccdc115Q8VE99 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccdc115Q8VE99 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccdc115Q8VE99 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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