Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ttc8Q8VD72 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc8Q8VD72 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms