Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hecw1Q8K4P8 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms