Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SrrdQ8K2M3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms