Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Hpf1Q8CFE2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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