Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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