Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SynpoQ8CC35 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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