Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Amigo3Q8C2S7 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms