Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms