Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cnpy4Q8BQ47 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnpy4Q8BQ47 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.2 ms