Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnrc6bQ8BKI2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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