Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atg4dQ8BGV9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atg4dQ8BGV9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atg4dQ8BGV9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atg4dQ8BGV9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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