Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubash3bQ8BGG7 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms