Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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H2-M10.4Q85ZW8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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