Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms