Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BC061212Q6P8K3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms