Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tpm4Q6IRU2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tpm4Q6IRU2 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tpm4Q6IRU2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tpm4Q6IRU2 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tpm4Q6IRU2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tpm4Q6IRU2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tpm4Q6IRU2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm4Q6IRU2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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