Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Atg9aQ68FE2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg9aQ68FE2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms