Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctnna3Q65CL1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctnna3Q65CL1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctnna3Q65CL1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctnna3Q65CL1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms