Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim28Q62318 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim28Q62318 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim28Q62318 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Trim28Q62318 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim28Q62318 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim28Q62318 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim28Q62318 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim28Q62318 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Trim28Q62318 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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