Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sema3cQ62181 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sema3cQ62181 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sema3cQ62181 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sema3cQ62181 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Sema3cQ62181 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sema3cQ62181 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Sema3cQ62181 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms