Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf3Q60980 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms