Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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DbpQ60925 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
DbpQ60925 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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