Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms