Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Tdrd5Q5VCS6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Tdrd5Q5VCS6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tdrd5Q5VCS6 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms