Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtl5Q5DTT4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms