Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zmat1Q3V0C1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zmat1Q3V0C1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms