Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms