Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem253Q3UNB8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem253Q3UNB8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem253Q3UNB8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem253Q3UNB8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem253Q3UNB8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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